资财审计部负责上海分院资产、基建、财务、审计相关工作。承担分院机关财务、资产和基建管理；承担对系统研究所的审计工作；承担分院系统财务、基建、资产等工作的协调沟通。负责管理财务审计处、资产（基建）管理处。
